R语言 inveRsion包 accBic()函数中文帮助文档(中英文对照)

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accBic(inveRsion)
accBic()所属R语言包：inveRsion

                                        accBic computes "accuracy" from "inversionList"
                                         accBic计算“inversionList”的“精度”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

accBic computes the accuracy of the classification of chromosomes into previously known inverted and non-inverted populations. The classification is obtained from a majority vote of the classifications produced by the trial segment models whose BIC is greater than a given threshold.
accBic计算到以前称为反相和非反相人口的染色体分类的准确性。分类获得多数票的BIC是大于给定阈值的试验段模型所产生的分类。


用法----------Usage----------


accBic(object, mem, classFile, nsub, npoints, geno, wROI)



参数----------Arguments----------

参数：object
of class inversionList  
类inversionList


参数：mem
vector with the numbering of chromosomes known to have the inversion   
向量与已知的染色体的编号有反转


参数：classFile
an alternative to mem, it passes the file name containing the numbering of chromosomes known to have the inversion.   
mem替代，它传递的文件名含有已知有反转的染色体编号。


参数：nsub
total number of subjects (= 2* total number of chromosomes)  
科目总数（= 2 *染色体总数）


参数：npoints
number of BIC threshold between 0 and max (BIC) for which the accuracy is to be computed  
介于0和最大的阈值的BIC号（BIC）要计算的准确性


参数：geno
whether the accuracy is assessed for inversion genotype or inversion allele (phased data).   
是否评估反演的基因型或反转基因（分阶段资料）的准确性。


参数：wROI
integer indicating the ROI number to be used. The total number of ROIs are the total number of components in the object list.  
整数，表示要使用的投资回报率。总数的投资回报是总组件object列表的数量。


值----------Value----------


参数：<code>accuracy</code>
object of class accuracy
对象类accuracy


作者（S）----------Author(s)----------



Alejandro Caceres <a href="mailto:acaceres@creal.cat">acaceres@creal.cat</a>



参见----------See Also----------

inversionList, accuracy
inversionList，accuracy


举例----------Examples----------


data(invList)
memFile <- system.file("extdata", "mem.txt", package = "inveRsion")
ac <- accBic(invList, classFile = memFile, nsub = 1000, npoints = 10)
plot(ac)

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