R语言 imageHTS包 countObjects()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

countObjects(imageHTS)
countObjects()所属R语言包：imageHTS

                                        Count the number of objects in a segmented image
                                         在分割图像计数的对象数量

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Count the number of objects in a segmented image.
在分割图像计数的对象数量。


用法----------Usage----------


countObjects(cseg)



参数----------Arguments----------

参数：cseg
An image containing the objects.
图像包含的对象。


值----------Value----------

An integer indicating the number of objects in the cell mask.
一个整数，指示单元面膜中的对象的数量。


作者（S）----------Author(s)----------



Gregoire Pau, <a href="mailto:gregoire.pau@embl.de">gregoire.pau@embl.de</a>, 2010




参见----------See Also----------

segmentWells
segmentWells


举例----------Examples----------


## initialize imageHTS object using the local submorph screen[＃初始化imageHTS对象使用当地submorph屏幕。]
local = tempdir()
server = system.file('submorph', package='imageHTS')
x = parseImageConf('conf/imageconf.txt', localPath=local, serverURL=server)
x = configure(x, 'conf/description.txt', 'conf/plateconf.txt', 'conf/screenlog.txt')

## segment one well[＃段一口井]
uname = getUnames(x, content='rluc')[1]
z = segmentWells(x, uname=uname, segmentationPar='conf/segmentationpar.txt', writeData=FALSE)
n = countObjects(z$cseg)
cat('number of cells=', n, '\n')

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