R语言 ibh包 ibhForMultipleGeneListsBioGRID()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ibhForMultipleGeneListsBioGRID(ibh)
ibhForMultipleGeneListsBioGRID()所属R语言包：ibh

                                       
                                         

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function calculated interactios based homogeneity for multiple gene lists according to the  BioGRID  Interactions for seven organisms: Arabidopsis thaliana(arabidopsis), Caenerhabditis elegans(c.elegans),  Drosophila melanogaster (fruitFly), Homo sapiens (human), Mus musculus (mouse), Saccharomyces cerevisae  (yeast), Schizosaccharomyces pombe (s.pombe). Unique ids(systematic names), official names or Entrez ids
这个函数的计算interactios基于多基因同质列出了根据7生物体BioGRID的相互作用：拟南芥（拟南芥），（线虫）Caenerhabditis线虫，果蝇（果蝇），智人（人类），小家鼠（小鼠） ，酿酒cerevisae（酵母），裂殖酵母（裂殖酵母）。唯一的ID（系统名称），正式名称或Entrez的IDS


用法----------Usage----------


ibhForMultipleGeneListsBioGRID(listofGeneList,
                         organism, idType = "EntrezId")



参数----------Arguments----------

参数：listofGeneList
List of list of genes/proteins for which interaction based homogeneity is evaluated.
被评为基于交互的同质基因/蛋白质的名单列表。


参数：organism
Organism name. Can be one of 'arabidopsis', 'c.elegans', 'fruitFly', 'human', 'mouse', 'yeast', 's.pombe'.   
生物体的名称。可以是一个“拟南芥”，“线虫”，“果蝇”，“人权”，“鼠标”，“酵母”，“裂殖酵母”。


参数：idType
Type of identifier. Can be one of 'EntrezId', 'Official' and 'UniqueId'.  
标识符类型。可以一个“EntrezId，官和的UniqueID。


值----------Value----------

A vector of floats representing interaction based homogeneity for each list
一个基于同质性互动为每个列表的花车向量


参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

ibh
ibh


举例----------Examples----------


        require(simpIntLists)
        listofGeneList <- list(list(839226,817241, 824340, 832179, 818561, 831145,
                                838782, 826404),
                                list( 832018, 839226, 839226, 838824));
        ibhForMultipleGeneListsBioGRID(listofGeneList,
                        organism="arabidopsis",  idType = "EntrezId");
        listofGeneList <- list(list("YJR151C", "YBL032W",   "YAL040C",   "YBL072C",   
                                "YCL050C",   
                                "YCR009C"), list("YDR063W", "YDR074W", "YDR080W", "YDR247W",
                                "YGR183C", "YHL033C"), list("YOL068C" , "YOL015W" ,  
                                "YOL009C" , "YOL004W" , "YOR065W"  ));
        ibhForMultipleGeneListsBioGRID(listofGeneList,
                organism="yeast", idType = "UniqueId");

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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