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R语言 ibh包 ibhClusterEval()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 22:07:42 | 显示全部楼层 |阅读模式
ibhClusterEval(ibh)
ibhClusterEval()所属R语言包:ibh

                                       
                                         

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function calculated interaction based homogeneity for a clustering result.
此函数计算基于交互的同质化的聚类结果。


用法----------Usage----------


ibhClusterEval(cluster, allGenesList, interactionList)



参数----------Arguments----------

参数:cluster
result of clustering  
导致聚类


参数:allGenesList
list of genes in the same order of clustering object  
在相同的顺序聚类对象的基因列表


参数:interactionList
list containing the interactions. For each gene/protein, the is an entry in the list with "name"  containing name of the gen/protein and "interactors" containing the list of genes/proteins interacting with it.
列表,其中包含的相互作用。对于每个基因/蛋白,是“名称”含根/蛋白质和“团团员”包含与它相互作用的基因/蛋白质列表名称列表中的条目。


值----------Value----------

A vector of floats representing interaction based homogeneity for each cluste
的代表为每个cluste互动基于同质化的花车向量


举例----------Examples----------


require(yeastCC)
require(stats)
data(yeastCC)
require(simpIntLists)
data(YeastBioGRIDInteractionUniqueId)

subset <- exprs(yeastCC)[1:50,]
d <- dist(subset,method="euclidean")
k <- kmeans(d, 3);
ibhClusterEval(k$cluster, rownames(subset),
                        YeastBioGRIDInteractionUniqueId)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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