R语言 htSeqTools包 countHitsWindow()函数中文帮助文档(中英文对照)

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countHitsWindow(htSeqTools)
countHitsWindow()所属R语言包：htSeqTools

                                         Compute number of hits in a moving window along the chromosome.
                                         在沿染色体的移动窗口计算点击次数。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computes a smoothed number of hits along the chromosome by using moving windows of user specified size.
通过使用用户指定大小的移动窗口计算的沿染色体的命中平滑。


用法----------Usage----------


countHitsWindow(x, chrLength, windowSize = 10^4 - 1)



参数----------Arguments----------

参数：x
Object containing hits (start, end and chromosome). Currently only RangedData objects are accepted.
对象（起点，终点和染色体）含命中。目前只有RangedData对象接受。


参数：chrLength
Named vector indicating the length of each chromosome in base pairs.
名为向量表示每个染色体的碱基对的长度。


参数：windowSize
Size of the window used to smooth the hit count.
命中计数用来平滑窗口的大小。


方法----------Methods----------

x contains chromosome, start and end positions for each hit.
x包含染色体的每一击，开始和结束位置。


举例----------Examples----------


set.seed(1)
st <- round(rnorm(1000,500,100))
st[st>=10000] <- 10000
strand <- rep(c('+','-'),each=500)
space <- rep('chr1',length(st))
x <- RangedData(IRanges(st,st+38),strand=strand,space=space)
countHitsWindow(x, chrLength=c(chr1=10000), windowSize=99)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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