R语言 HTSanalyzeR包 plotEnrichMap()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotEnrichMap(HTSanalyzeR)
plotEnrichMap()所属R语言包：HTSanalyzeR

                                         Plot and save an enrichment map for results of GSEA or hypergeometric tests
                                         绘制和保存GSEA或超几何测试结果的富集图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This is a generic function.
这是一个通用的功能。

When implemented as the S4 method for objects of class GSCA, this function  will plot and save an enrichment map for GSEA or Hypergeometric test results.  
当为中S4中为GSCA类的对象的方法实现，这个函数将绘制并保存一个的GSEA或超几何测试结果的富集图。

To use this function for objects of class GSCA:
使用此功能的类对象GSCA：

plotEnrichMap(object, resultName="GSEA.results", gscs, ntop=NULL,  allSig=TRUE, gsNameType="id", displayEdgeLabel=TRUE, layout= "layout.fruchterman.reingold", filepath=".", filename="test.png",  output="png", ...)
plotEnrichMap（对象，resultName =“GSEA.results”GSCS，NTOP = NULL，allSig = TRUE，gsNameType =“身份证”，displayEdgeLabel = TRUE，布局=的“layout.fruchterman.reingold”的文件路径=“。 “文件名=”test.png“，输出=”PNG“，...）


用法----------Usage----------


plotEnrichMap(object, ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an object. When this function is implemented as the S4 method of class GSCA,  this argument is an object of class GSCA.  
一个对象。作为的S4类方法实现此功能时，GSCA，这种说法是一种类GSCA的对象。


参数：...
other arguments. (see below for the arguments supported by the method of class GSCA)  
其他参数。 （见下面的类的方法GSCA支持的论据）


Details

详情----------Details----------

See help(viewEnrichMap) for more details about the enrichment map for GSEA.
参见帮助，GSEA富集图更多细节（viewEnrichMap）。


作者（S）----------Author(s)----------



Xin Wang <a href="mailto:xw264@cam.ac.uk">xw264@cam.ac.uk</a>




参见----------See Also----------

viewEnrichMap
viewEnrichMap


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
library(org.Dm.eg.db)
library(KEGG.db)
##load data for enrichment analyses[＃加载富集分析数据。]
data("KcViab_GSCA")
##plot and save the enrichment map[＃绘制和保存的丰富图]
plotEnrichMap(KcViab_GSCA, gscs=c("GO_MF"), allSig=TRUE, ntop=NULL, gsNameType="id",
displayEdgeLabel=FALSE,layout="layout.fruchterman.reingold", filepath="~",
filename="GO_MF.pdf",output="pdf", width=8, height=8)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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