R语言 HTSanalyzeR包 GOGeneSets()函数中文帮助文档(中英文对照)

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GOGeneSets(HTSanalyzeR)
GOGeneSets()所属R语言包：HTSanalyzeR

                                         Create a list of gene sets based on GO terms
                                         创建一个基因列表基于GO术语集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function creates a list of gene sets based on GO terms. It is species-specific, and returns a list of gene sets, each of which  is a character vector of Entrez identifiers.
这个函数创建的基因名单设置基于GO术语。它是特定物种，并返回一个基因组的列表，其中每个是一个Entrez的标识符的字符向量。


用法----------Usage----------


GOGeneSets(species = "Dm", ontologies = "MF")



参数----------Arguments----------

参数：species
a single character value specifying a choice of species: "Dm" ("Drosophila_ melanogaster"), "Hs" ("Homo_sapiens"), "Rn" ("Rattus_norvegicus"), "Mm" ("Mus_musculus") or "Ce" ("Caenorhabditis_elegans"))  
一个单一的字符值，指定一个物种的选择：“DM”（“Drosophila_果蝇”），“HS”（“Homo_sapiens”），“RN”（的“Rattus_norvegicus”），“MM”（“ ; Mus_musculus“）或”CE“（”Caenorhabditis_elegans））


参数：ontologies
a single character value or a character vector specifying an ontology or multiple ontologies. The current version provides the following choices:  "BP", "CC" and "MF"  
一个单一的字符值或指定本体或多个本体的特征向量。目前的版本提供了以下选择：“BP”，“抄送”和“MF”


Details

详情----------Details----------

This function relies on the following packages: GSEABase, GO.db, and either org.Hs.eg.db, org.Mm.eg.db, org.Rn.eg.db, org.Ce.eg.db, org.Dm.eg.db.
此功能依赖于以下包：GSEABase，GO.db，要么org.Hs.eg.db org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db，org.Ce.eg.db，ORG。 dm.eg.db.


值----------Value----------

a list of gene sets, with names as GO IDs. Each gene set is a character  vector of Entrez identifiers.
一个基因集的列表，用好标识的名称。每个基因组是一个Entrez的标识符的字符向量。


作者（S）----------Author(s)----------



Camille Terfve




参见----------See Also----------

KeggGeneSets
KeggGeneSets


举例----------Examples----------


library(GO.db)
library(org.Dm.eg.db)
Dm_GO_CC<-GOGeneSets(species="Dm",ontologies=c("CC"))

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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