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R语言 HTSanalyzeR包 duplicateRemover()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 21:54:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
duplicateRemover(HTSanalyzeR)
duplicateRemover()所属R语言包:HTSanalyzeR

                                         Remove duplicates in a named vector of phenotypes
                                         删除重复在一个命名的表型向量

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function gets rid of the duplicates in a vector of phenotypes with  gene identifiers as names. It is used to prepare the named vector of  phenotypes for the over-representation and enrichment analysis.
此功能得到消除重复在一个标识符作为名称基因表型的向量。它是用来准备的代表性和富集分析表型的命名向量。


用法----------Usage----------


duplicateRemover(geneList, method = "max")



参数----------Arguments----------

参数:geneList
a single named numeric or integer vector with gene identifiers as names  
一个命名的数字或整数的向量与基因标识名


参数:method
a single character value specifying the method to remove the duplicates  (should the minimum, maximum or average observation for a same construct  be kept). The current version provides "min" (minimum), "max" (maximum),  "average" and "fc.avg" (fold change average). The minimum and maximum  should be understood in terms of absolute values (i.e. min/max effect,  no matter the sign). The fold change average method converts the fold  changes to ratios, averages them and converts the average back to a  fold change.  
一个单一的字符值,指定的方法来删除重复(应保持的最低,最高或平均为同一构造的观察)。目前的版本提供了“MIN”(最小),“最大”(最高),“一般”和“fc.avg”(倍平均变化)。应被理解的最小和最大绝对值(即最小/最大的影响,无论是符号)。倍平均法转换率,平均他们的fold change和转换的平均回褶皱的变化。


值----------Value----------

a named vector of phenotypes with duplicates removed
删除重复向量的表型的命名


作者(S)----------Author(s)----------



Camille Terfve, John C. Rose and Xin Wang




参见----------See Also----------

preprocess
preprocess


举例----------Examples----------


x<-c(5,1,3,-2,6)
names(x)<-c("gene1","gene3","gene7","gene3","gene4")
xprocessed<-duplicateRemover(geneList=x,method="max")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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