plotCtCor(HTqPCR)
plotCtCor()所属R语言包:HTqPCR
Correlation between Ct values from qPCR data
qPCR数据的Ct值之间的相关性
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function for plotting the correlation based on Ct values between samples containing high-throughput qPCR data.
基于含高通量qPCR数据样本之间的Ct值绘制相关的功能。
用法----------Usage----------
plotCtCor(q, col, col.range = c(0, 1), main, mar, ...)
参数----------Arguments----------
参数:q
object of class qPCRset.
对象类qPCRset。
参数:col
vector of colours to use, defaults to a spectrum from red to blue/purple.
向量使用的颜色,默认为从红色到蓝色/紫色频谱。
参数:col.range
vector, the range of colours to use.
向量,使用的颜色范围。
参数:main
character string, plot title.
字符串,小区称号。
参数:mar
vector, the size of the borrom and right hand side margins.
向量,的borrom和右侧边缘的大小。
参数:...
any other arguments will be passed to the heatmap.2 function.
任何其他参数将被传递给heatmap.2功能。
Details
详情----------Details----------
This function may be used to cluster the samples based on Ct values and present the result in a heatmap. Per default the colours are a rainbow scale from 0 to 1.
此功能可用于聚类基于Ct值的样品,并提出在热图的结果。每个默认的颜色是彩虹规模从0到1。
A standard heatmap is drawn, but this can be modified extensively using the arguments available in the heatmap.2 function.
一个标准的热图绘制,但可以修改广泛使用heatmap.2函数的参数。
值----------Value----------
A plot is created on the current graphics device.
当前图形设备上创建一个图。
作者(S)----------Author(s)----------
Heidi Dvinge
参见----------See Also----------
heatmap.2
heatmap.2
举例----------Examples----------
data(qPCRraw)
plotCtCor(qPCRraw)
plotCtCor(qPCRraw, col.range=c(0.5,0.8))
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注:
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