R语言 Heatplus包 plot.annHeatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plot.annHeatmap(Heatplus)
plot.annHeatmap()所属R语言包：Heatplus

                                        Plotting method for annotated heatmaps
                                         注释热图的绘制方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plotting method for annotated heatmaps
注释热图的绘制方法


用法----------Usage----------


    ## S3 method for class 'annHeatmap'
plot(x, widths, heights, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
an object of class annHeatmap
一个对象类annHeatmap


参数：widths
a numerical vector giving the widths of the sub-plots currently defined
当前定义的子图的宽度数值向量


参数：heights
a numerical vector giving the heights of the sub-plots currently defined     
当前定义的子图的高度数值向量


参数：...
extra graphical parameters, currently ignored
额外的图形参数，目前被忽略


Details

详情----------Details----------

This function displays an annotated heatmap object that has been previously generated by annHeatmap2 or on of its wrappers. The arguments widths and heights work as in layout.
此功能显示先前已annHeatmap2或者其包装上生成的注释热图对象。论据widths和heights工作layout。


值----------Value----------

x, invisibly returned. If widths or heights have been specified, they overwrite the corresponding items x$layout$width and x$layout$height in x.
x，无形中返回。如果widths或heights已被指定，他们覆盖相应的项目x$layout$width和x$layout$heightx。


参见----------See Also----------

annHeatmap2, heatmapLayout, layout
annHeatmap2，heatmapLayout，layout


举例----------Examples----------


    ## Define the map[＃定义图]
    require(Biobase)
    data(sample.ExpressionSet)
    ex1 = sample.ExpressionSet[51:85,]
    map1 = annHeatmap2(exprs(ex1), ann=list(Col=list(data=pData(ex1))),
                   cluster=list(Col=list(cuth=3000)))
   
    ## Plot it               [＃图]
    plot(map1)
   
    ## More heatmap, smaller dendrogram/annotation[＃热图更多，更小的聚类分析/注释]
    map2 = plot(map1, heights = c(1,6,1))
   
    ## Compare layout before/after[＃比较前/后的布局]
    with(map1$layout, layout(plot, width, height))
    layout.show(4)
    with(map2$layout, layout(plot, width, height))
    layout.show(4)

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