R语言 Heatplus包 annHeatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

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annHeatmap(Heatplus)
annHeatmap()所属R语言包：Heatplus

                                        Annotated heatmaps
                                         注解热图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creating heatmaps with annotated columns
创建列注释的热图


用法----------Usage----------


    annHeatmap(x, ...)

    ## Default S3 method:
annHeatmap(x, annotation, dendrogram = list(clustfun = hclust, distfun = dist, Col = list(status = "yes"), Row = list(status = "hidden")), cluster = NULL, labels = NULL, legend = TRUE, ...)

    ## S3 method for class 'ExpressionSet'
annHeatmap(x, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
either a numerical matrix with the data for the central heatmap (for the default method) or an object of class ExpressionSet   
无论是中央热图（默认方法）的数据的数值矩阵或对象类ExpressionSet


参数：annotation
a data frame containing the annotation for the columns of x  
一个数据框包含x列注释


参数：dendrogram
a list controlling the options for row- and column dendrogram, see annHeatmap2  
控制行和列树状选项列表，请参阅annHeatmap2


参数：cluster
a list controlling the options for clustering rows and columns of x, see annHeatmap2  
列表控制的聚类行x的列选项，看到annHeatmap2


参数：labels
a list controlling the row- and column labels as well as their location and size, see annHeatmap2   
控制行和列的标签，以及他们的位置和大小的列表，请参阅annHeatmap2


参数：legend
either a logical value, indicating whether to draw a legend at the default location determined by the function, or one of the sides of the plot (1-4), see annHeatmap2  
无论是逻辑值，指示是否提请一个传奇，在由功能决定的默认位置，或一个图（1-4）的两侧，看到annHeatmap2


参数：...
extra options passed to annHeatmap2  
额外的选项，通过annHeatmap2


Details

详情----------Details----------

These functions generate an object representing the heatmap; in order to produce graphical output, you have to invoke the plot method, see Examples.
这些函数生成的对象代表的热图，以生产图形输出，你必须调用plot方法，看到的例子。


值----------Value----------

An object of class annHeatmap
一个对象的类annHeatmap


警告----------Warning----------

These are currently simple convenience functions that allow quick plotting, but little control over the finer details. This may change in the future, but for now, if you want to do anything fancy, you should invoke annHeatmap2 directly.
这是目前简单方便的功能允许快速绘图，但在细节的小控制。这可能会改变未来，但现在，如果你想要做的任何幻想，你应该调用annHeatmap2直接。


参见----------See Also----------

annHeatmap2, plot.annHeatmap
annHeatmap2，plot.annHeatmap


举例----------Examples----------



    ## Default method[＃缺省方法]
    set.seed(219)
    mat = matrix(rnorm(100), ncol=5)
    ann = data.frame(Class=c("A","A","B","A","B"))
    map1 = annHeatmap(mat, ann)
    plot(map1)
   
    ## Expression set[＃表达式设置]
    require(Biobase)
    data(sample.ExpressionSet)
    map2 = annHeatmap(sample.ExpressionSet)
    plot(map2)

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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