R语言 GWASTools包 ncdfCreate()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ncdfCreate(GWASTools)
ncdfCreate()所属R语言包：GWASTools

                                         Write genotypic calls and/or associated metrics to a netCDF file.
                                         写的基因型分型和/或一个netCDF文件的相关指标。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function creates a shell netCDF file to which data can subsequently written.
该函数创建一个shell netCDF文件数据可以随后被写入。


用法----------Usage----------


ncdfCreate(snp.annotation, ncdf.filename, variables = "genotype",
           n.samples = 10, precision = "double",
           array.name = NULL, genome.build = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：snp.annotation
Snp annotation dataframe with columns "snpID", "chromosome", and "position".  snpID should be a unique integer vector, sorted with respect to chromosome and position.
SNP注解dataframe的与列的“snpID”，“染色体”，和“位置”。 snpID应该是一个独特的的整数向量，染色体和位置排序。


参数：ncdf.filename
The name of the genotype netCDF file to create
基因型NetCDF的名称文件创建


参数：variables
A character vector containing the names of the variables to create (must be one or more of c("genotype", "quality", "X", "Y", "rawX", "rawY", "R", "Theta", "BAlleleFreq", "LogRRatio"))
字符向量创建的变量的名称（必须有一个或更多的c("genotype", "quality", "X", "Y", "rawX", "rawY", "R", "Theta", "BAlleleFreq", "LogRRatio")）


参数：n.samples
The number of samples that will be in the netcdf file.
netCDF文件，这将是在样品的数量。


参数：precision
A character value indicating whether floating point numbers should be stored as "double" or "single" precision.
一个字符值，该值指示是否应为“双重”或“单”精确存储浮点数。


参数：array.name
Name of the array, to be stored as an attribute in the netCDF file.
数组的名称，可以存储为netCDF文件的属性。


参数：genome.build
Genome build used in determining chromosome and position, to be stored as an attribute in the netCDF file.
建立用于基因在染色体和位置确定，将存储作为一个netCDF文件的属性。


Details

详情----------Details----------

The function creates a shell netCDF file to which data can subsequently written.
该函数创建一个shell netCDF文件数据可以随后被写入。


作者（S）----------Author(s)----------



Cathy Laurie




参见----------See Also----------

ncdf, ncdfAddData, ncdfSubset
ncdf，ncdfAddData，ncdfSubset


举例----------Examples----------


library(GWASdata)
data(affy_snp_annot)
ncfile <- tempfile()
ncdfCreate(affy_snp_annot, ncfile, variables="genotype", n.samples=5)
file.remove(ncfile)

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