R语言 GRENITS包 read.chain()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

read.chain(GRENITS)
read.chain()所属R语言包：GRENITS

                                        Read MCMC Chains
                                         阅读的MCMC链

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read MCMC chains for further analysis.
阅读的MCMC链作进一步的分析。


用法----------Usage----------


read.chain(output.folder, chainNumber)



参数----------Arguments----------

参数：output.folder
Name of folder (including path) where chains are kept
链保持文件夹的名称（包括路径）


参数：chainNumber
Which of the chains will be read
它的连锁店将读取


Details

详情----------Details----------

Read chains produced by NonLinearNet, LinearNet, ReplicatesNet_student and ReplicatesNet_gauss  for further analysis.
读作进一步的分析，由NonLinearNet，LinearNet，ReplicatesNet_student和ReplicatesNet_gauss生产链。


值----------Value----------

Returns a list of vectors/matrices with the value of the variables at each MCMC iteration.   
返回变量的值在每个的MCMC迭代向量/矩阵列表。


参考文献----------References----------

networks using time course data with repeated measurements.  Bioinformatics 2010; doi: 10.1093/bioinformatics/btq421
topology of a nonlinear sparse gene regulatory network using fully Bayesian spline autoregression Biostatistics 2011; doi: 10.1093/biostatistics/kxr009

参见----------See Also----------

NonLinearNet, LinearNet,  ReplicatesNet_student , ReplicatesNet_gauss .
NonLinearNet，LinearNet，ReplicatesNet_student ，ReplicatesNet_gauss 。


举例----------Examples----------


  #############################################[＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
  ## Run inference using one chain[＃运行推论使用一个链]
  #############################################[＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
  # Load A. thaliana circadian clock ODE generated data[生成的数据负载拟南芥生物钟的ODE]
  data(Athaliana_ODE)
  # Folder where raw runs will be kept and analysed[原料运行文件夹中，将保留和分析]
  output.folder <- paste(tempdir(), "/Example_LinearNet", sep="")
  # Run network inference, place raw results in output.folder[运行网络推断，原始结果将在output.folder]
  # Run just one chain for example purpose[运行例子的目的只是为了一个链]
  LinearNet(output.folder, Athaliana_ODE, chains = 1)

  ###########################[＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
  ## Read chain [＃阅读链]
  ###########################[＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
  chain1 <- read.chain(output.folder, 1)

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