mcmc.defaultParams_nonLinear(GRENITS)
mcmc.defaultParams_nonLinear()所属R语言包：GRENITS
Default Parameters for non-Linear Model
非线性模型的默认参数
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Create parameter vector with default parameters for NonLinearNet function
创建具有默认参数NonLinearNet功能参数向量
用法----------Usage----------
mcmc.defaultParams_nonLinear()
Details
详情----------Details----------
Use this function to generate a template parameter vector to use non-default parameters for the NonLinearNet model.
使用此功能来生成一个模板参数向量使用非默认为NonLinearNet模型参数。
值----------Value----------
Returns a single vector with the following elements (in this order):
一个向量返回与下列元素（按此顺序）：
参数：(1) samples
Number of MCMC iterations to run.
数量的MCMC迭代运行。
参数：(2) burn.in
Number of initial iterations to discard as burn in.
初始迭代的数量，放弃烧英寸
参数：(3) thin
Subsampling frequency
欠采样频率
参数：(4) c
Shape parameter 1 for Beta(c,d) prior on rho (connectivity parameter)
形状参数1β（C，D）前对RHO（连通参数）
参数：(5) d
Shape parameter 2 for Beta(c,d) prior on rho (connectivity parameter)
形状参数β（C，D）2前对RHO（连通参数）
参数：(6) trunc
Truncation parameter for InvertedPareto prior on tau (smoothness parameter)
截断参数InvertedPareto头前（光滑参数）
参数：(7) tau0
Precision parameter for N(0, tau0^(-0.5)) prior on B (first two coefficients)
精度参数为N（0，tau0 ^（-0.5））前对B（前两个系数）
参数：(8) M
Numer of knots used for each spline function
用于每个样条函数节numer
参数：(9) a
Shape parameter for Gamma(a,b) prior on lambda (Regression precision)
形状参数的伽玛（A，B）之前的lambda（回归精度）
参数：(10) b
Rate parameter for Gamma(a,b) prior on lambda (Regression precision)
伽马率参数（A，B）之前，在λ（回归精度）
参数：(11) sigma.mu
Standard deviation parameter for N(0,sigma.mu) prior on mu (Regression intercept)
标准偏差参数为N（0，sigma.mu）前亩（回归截距）
参数：(12) a_pareto
Pareto parameter for InvertedPareto prior on tau (smoothness parameter)
帕累托参数InvertedPareto头前（光滑参数）
参考文献----------References----------
topology of a nonlinear sparse gene regulatory network using fully Bayesian spline autoregression Biostatistics 2011; doi: 10.1093/biostatistics/kxr009
参见----------See Also----------
plotPriors, NonLinearNet.
plotPriors，NonLinearNet。
举例----------Examples----------
# Get default parameters[获取默认参数]
nonLinearNet.params <- mcmc.defaultParams_nonLinear()
# Change run length[变更运行长度]
nonLinearNet.params[1] <- 150000
# Change prior on smoothness parameter[改变之前对平滑参数]
nonLinearNet.params[6] <- 30000 # Change truncation [改变截断]
nonLinearNet.params[12] <- 3 # Concentrate more mass close to linear region[集中更多的质量接近线性区]
# Plot to check changes[图检查更改]
plotPriors(nonLinearNet.params)
## Use to run LinearNet ...[＃使用运行LinearNet ...]
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发表于 2012-2-25 21:14:39
