R语言 graph包 integrinMediatedCellAdhesion()函数中文帮助文档(中英文对照)

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integrinMediatedCellAdhesion(graph)
integrinMediatedCellAdhesion()所属R语言包：graph

                                        KEGG Integrin Mediated Cell Adhesion graph
                                         KEGG整合素介导的单元粘附图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A graph representing the integrin-mediated cell adhesion pathway from KEGG, as well as a list of attributes for use in plotting the graph with Rgraphviz.  
一个图代表从KEGG整合素介导的单元粘附的途径，以及绘制的图Rgraphviz使用的属性列表。


用法----------Usage----------


data(integrinMediatedCellAdhesion)



Details

详情----------Details----------

The integrinMediatedCellAdhesion data set contains two objects:
integrinMediatedCellAdhesion数据集包含两个对象：

The first is IMCAGraph, which is an object of class graph-NEL and represents the hsa04510 graph from KEGG.
首先是：IMCAGraph类graph-NEL这是一个对象，并表示从KEGGhsa04510图。

The second is IMCAAttrs, which is a list of four elements.  The first element, defAttrs corresponds to the attrs arguments of agopen and  plot.graph.  The second element is nodeAttrs which corresponds to the nodeAttrs argument in the same two functions from Rgraphviz.  The third element, subGList corresponds to the subGList argument in those functions.  Lastly, the fourth element, LocusLink provides a named list where the names are the nodes and the values are vectors of LocusLink ID values which correspond to those nodes.
二是的IMCAAttrs，这是四个要素列表。第一个元素，defAttrs的attrsagopen和plot.graph参数对应。第二个元素是对应nodeAttrs参数，在两个相同的功能nodeAttrsRgraphviz。第三个元素，subGListsubGList在这些函数的参数对应。最后，第四个元素，LocusLink提供了一个名为列表的名称节点和值LocusLink ID值对应到这些节点的向量。

The values from defAttrs, nodeAttrs and subGList in the IMCAAttrs list are part of an ongoing attempt by Bioconductor to provide the set of options to most accurately recreate the actual visual image of the pathway from the KEGG site using Rgraphviz.  Users may try out their own combination of attributes and settings for their own needs, but these represent our own efforts at as closely recreating the image as possible.
从值defAttrs，nodeAttrs和subGListIMCAAttrs列表Bioconductor不断尝试提供一组选项，最准确地重现实际的视觉形象的一部分从KEGG使用Rgraphviz网站的途径。用户可能会尝试他们自己的属性和自己的需要设置的组合，但这些代表我们自己的努力，在尽可能密切重新图像。


源----------Source----------

http://www.genome.ad.jp/kegg/pathway/hsa/hsa04510.html



举例----------Examples----------


data(integrinMediatedCellAdhesion)
if (require("Rgraphviz") & interactive())
  plot(IMCAGraph, attrs=IMCAAttrs$defAttrs,
       nodeAttrs=IMCAAttrs$nodeAttrs, subGList=IMCAAttrs$subGList)

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