R语言 GraphAT包 giaever()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

giaever(GraphAT)
giaever()所属R语言包：GraphAT

                                        Yeast Gene-Knockout Fitness Data
                                         酵母基因敲除健身数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set contains fitness deficiency scores from gene knockout experiments involving yeast grown under a variety of altered environments (e.g. acid, heat, sorbitol, etc.)  
该数据集包含从基因敲除实验健身缺损评分，涉及各种改变环境下生长的酵母（如酸，热，山梨醇等）


用法----------Usage----------


data(giaever)



格式----------Format----------

A matrix whose rows are the 5922 genes knocked out and whose columns are the 32 experimental conditions.
一个矩阵，其行5922基因敲其列32的实验条件下。


源----------Source----------

http://gobi.lbl.gov/YeastFitnessData



参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


data(giaever)

## Find the 3000 most variable genes, according to sd/mean:[＃3000最可变区基因，根据SD /意思是：]
varMeas <- function(vec, na.rm=TRUE)
{
    if(na.rm)
      vec <- vec[!is.na(vec)]
    if(length(vec) == 0)
      measure <- NA
    else
      measure <- sd(vec)/mean(vec)
    return(measure)
}

variability <- apply(giaever, 1, varMeas)

rks <- rank(variability)

giaever3000 <- giaever[rks>length(rownames(giaever))-3000,]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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