causton(GraphAT)
causton()所属R语言包:GraphAT
Yeast mRNA Expression Data
酵母基因表达数据
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This data set contains mRNA expression from a microarray experiment involving yeast grown under a variety of altered environments (e.g. acid, heat, sorbitol, etc.)
该数据集包含了从芯片实验涉及各种改变环境下生长的酵母(如酸,热,山梨醇等)的mRNA表达
用法----------Usage----------
data(causton)
格式----------Format----------
A matrix whose rows are the 6015 genes and whose columns are the 45 experimental conditions.
A矩阵,其行的6015个基因,其列是45的实验条件。
源----------Source----------
http://web.wi.mit.edu/young/environment
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
data(causton)
## Find the 3000 most variable genes, according to sd/mean:[#3000最可变区基因,根据SD /意思是:]
varMeas<-function(vec) sd(vec)/mean(vec)
variability<-apply(causton,1,varMeas)
rks<-rank(variability)
causton3000<-causton[rks>length(rownames(causton))-3000,]
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