R语言 goTools包 EndNodeList()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

EndNodeList(goTools)
EndNodeList()所属R语言包：goTools

                                        Reference GO nodes list.
                                         引用好节点列表。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function EndNodeList builds the default end node list used in ontoCompare. CustomEndNodeList helps you build a list of children nodes starting from a GO id of interest.
功能EndNodeList建立ontoCompare使用默认的结束节点列表。 CustomEndNodeList帮助您建立一个儿童权益的ID从开始节点的列表。


用法----------Usage----------


EndNodeList()
CustomEndNodeList(id,rank=1)



参数----------Arguments----------

参数：id
Valid GO id: "GO:XXXXXXX".
有效的好ID：“GO：XXXXXXX”。


参数：rank
Number of levels of children of the GO DAG under id you want to add to your nodes list.
孩子，你要添加到节点列表的ID下的好DAG的水平数。


值----------Value----------

EndNodeList returns a vector of all GO ids 1 level below MF("GO:0003674"), BP("GO:0008150") and CC("GO:0005575"). MF, BP and CC nodes are included. CustomEndNodeList returns a vector of all GO ids children of id, rank levels below it.
EndNodeList返回一个向量都去IDS 1级以下（MF“GO：0003674”），BP（“好：0008150”）和CC（“GO：0005575）。 MF，BP和CC节点都包括在内。 CustomEndNodeList返回一个IDS都去id，rank水平低于儿童的向量。


作者（S）----------Author(s)----------


Yee Hwa (Jean) Yang, Agnes Paquet



参见----------See Also----------

ontoCompare
ontoCompare


举例----------Examples----------


## Examples use the probeID dataset. For description type ? probeID.[＃例子使用probeID的集。描述类型？ probeID。]
## library(GO.db)[＃库（GO.db）]
## EndNodeList()[：＃EndNodeList（）]
## MFendnode &lt;- CustomEndNodeList("GO:0003674", rank=2)[＃MFendnode < -  CustomEndNodeList（“好：0003674”，排名= 2）]

## Example (not run)[＃示例（不运行）]
## data(probeID)[＃数据（probeID的）]
## ontoCompare(affylist, probeType="hgu133a", endnode=MFendnode, goType="MF")[＃ontoCompare（affylist，probeType =的“hgu133a”，endnode = MFendnode goType =“中频”）]


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