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R语言 GOstats包 oneGOGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 20:55:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
oneGOGraph(GOstats)
oneGOGraph()所属R语言包:GOstats

                                        Construct the GO graph given a set of leaves.  
                                         构建一套叶片的GO图。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given one or more GO identifiers (which indicate the leaves in the graph) and a set of mappings to the less specific sets of nodes this function will construct the graph that includes that node and all children down to the root node for the ontology.
由于一个或多个好标识符(这表明图中的叶子)和一套较具体的集节点的映射功能将构造图,其中包括该节点和所有的孩子下降到本体的根节点。


用法----------Usage----------


oneGOGraph(x, dataenv)
GOGraph(x, dataenv)
getGoGraph(p, goIds)




参数----------Arguments----------

参数:x
A character vector of GO identifiers.  
一个好标识符的字符向量。


参数:dataenv
An environment for finding the parents of that term.  
寻找父母术语的环境。


参数:p
A GOHyperGParams instance.
一个GOHyperGParams实例。


参数:goIds
A character vector providing the GO term IDs.
提供的GO术语标识一个特征向量。


Details

详情----------Details----------

For any set of GO identifiers (from a common ontology) we define the induced GO graph to be  that graph, based on  the DAG structure (child - parent) of the GO ontology of terms, which takes the most specific set of GO terms that apply (for that ontology) and then joins these to all less specific terms. These functions help construct such graphs.
我们对于任何一套好标识符(从一个共同的本体)定义的诱导图,基于DAG的结构图,(孩子 - 父母)好本体的条款,这需要一套最具体的GO术语,申请(本体论),然后加入这些都不太具体条款。这些功能帮助建立这样的图形。


值----------Value----------

The induced GO graph (or NULL) for the given GO identifier.
诱导的GO图(或NULL)为给定的好标识符。


作者(S)----------Author(s)----------


R. Gentleman



参见----------See Also----------

makeGOGraph
makeGOGraph


举例----------Examples----------



library("GO.db")
g1 <- oneGOGraph("GO:0003680", GOMFPARENTS)
g2 <- oneGOGraph("GO:0003701", GOMFPARENTS)
g3 <- join(g1, g2)

g4 <- GOGraph(c("GO:0003680", "GO:0003701"), GOMFPARENTS)
if( require("Rgraphviz") &amp;&amp; interactive() )
  plot(g3)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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