compGdist(GOstats)
compGdist()所属R语言包:GOstats
A function to compute the distance between pairs of nodes in a graph.
一个函数来计算图中的节点对之间的距离。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a graph, g, and a set of nodes in the graph, whNodes, Dijkstra's shortest path algorithm is used to compute the distance between all pairs of nodes in whNodes.
鉴于图形,g,一套图中的节点,whNodes,Dijkstra最短路径算法用来计算对所有节点之间的距离在whNodes。
用法----------Usage----------
compGdist(g, whNodes, verbose = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:g
An instance of the graph class.
graph类的一个实例。
参数:whNodes
A vector of lables of the nodes in g for which distances are to be computed.
一个向量g距离计算节点的标贴。
参数:verbose
If TRUE then output reporting the progress will be reported.
如果TRUE然后将报告输出报告的进展。
Details
详情----------Details----------
This function can be quite slow, computation of the pairwise distances is not especially fast and if whNodes is long then there are many of them to compute.
此功能可能会非常慢,计算成对的距离不是特别快,whNodes如果长那么其中有许多计算。
值----------Value----------
A matrix containing the pairwise distances. It might be worth making this an instance of the dist class at some point.
包含成对距离矩阵。它可能是值得dist在某些点类的一个实例。
作者(S)----------Author(s)----------
R. Gentleman
参见----------See Also----------
compCorrGraph
compCorrGraph
举例----------Examples----------
example(compCorrGraph)
compGdist(corrG, nodes(corrG)[1:5])
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注:
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