GeneClusterSet-class(GOSemSim)
GeneClusterSet-class()所属R语言包:GOSemSim
Class "GeneClusterSet"
类“GeneClusterSet”
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A GeneClusterSet contains a list of Gene clusters.
一个GeneClusterSet包含的基因簇。
插槽----------Slots----------
GeneClusters: containing a list of Gene clusters.
GeneClusters:含有基因簇的列表。
方法----------Methods----------
Gene Clusters semantic similarity measure :
基因簇的语义相似性度量:
sim signature(object = "GeneClusterSet", params="Params", value = "numeric")
SIMsignature(object = "GeneClusterSet", params="Params", value = "numeric")
作者(S)----------Author(s)----------
Guangchuang Yu <guangchuangyu@gmail.com>
参见----------See Also----------
GeneSet Params
GeneSetParams
举例----------Examples----------
## Setting Parameters...[#设置参数...]
params <- new("Params", ontology="MF", organism="human", method="Wang", combine="rcmax")
## Setting GeneClusterSet...[#设置GeneClusterSet ...]
cluster1 <- c("835", "5261","241", "994", "514", "517", "533")
cluster2 <- c("578","582", "583", "400", "409", "411")
cluster3 <- c("307", "308", "317", "321", "506", "540", "378", "388", "396")
clusters <- list(a=cluster1, b=cluster2, c=cluster3)
geneClusters <- new("GeneClusterSet", GeneClusters=clusters)
## Calculating Gene Clusters Semantic Similarities...[#计算基因簇的语义异同...]
# sim(geneClusters, params)[SIM(geneClusters,的params)]
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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