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R语言 GOFunction包 createGODAG()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 20:46:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
createGODAG(GOFunction)
createGODAG()所属R语言包:GOFunction

                                         Creation of GO DAG stucture for statistically significant GO terms
                                         统计显着的GO术语创造的好DAG的stucture

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

To plot the relationship between statistically significant GO terms, this function creates a GO DAG structure  for these terms.
绘制统计学意义的GO术语之间的关系,这个函数创建了一个好这些条款的DAG结构。


参数----------Arguments----------

参数:sigNodes
sigNodes is the statistically significant GO terms found by "enrichmentFunction" function.   
sigNodes是统计学意义的GO发现“enrichmentFunction”功能的条款。


参数:ontology
The default ontology is "BP" (Biological Process). The "CC" (Cellular Component) and "MF" (Molecular  Function) ontologies can also be used.  
默认ontology是“BP”(生物处理)。也可以用“CC”(蜂窝式元器件)及“MF”(分子功能)本体。


值----------Value----------

This function returns a object of 'graphNEL' class.
这个函数返回一个对象的graphNEL类。


注意----------Note----------

This function simulates the related program in TopGO (Alexa, A. et al. (2006) Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22, 1600-1607).
此功能模拟在TopGO的相关程序(网站,答等。(2006)改进的解相关好图结构从基因表达数据的功能组别的得分。生物信息学,22岁,1600年至1607年)。


作者(S)----------Author(s)----------



Jing Wang




参见----------See Also----------

GOFunction enrichmentFunction
GOFunctionenrichmentFunction

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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