R语言 GGtools包 mrefhap2sm()函数中文帮助文档(中英文对照)

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mrefhap2sm(GGtools)
mrefhap2sm()所属R语言包：GGtools

                                         transform MACH-supplied haplotype data for imputation into a SnpMatrix instance
                                         转变成SnpMatrix实例归集马赫提供的单体型数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

transform MACH-supplied haplotype data for imputation into a SnpMatrix instance
转变成SnpMatrix实例归集马赫提供的单体型数据


用法----------Usage----------


mrefhap2sm(gzfn, snpids)



参数----------Arguments----------

参数：gzfn
name of gzipped file with haplotype sequences  
单体型序列的gzip文件的名称


参数：snpids
vector of unique SNP ids for the haplotype elements  
独特的SNP IDS的单体元素的向量


Details

详情----------Details----------

uses read.snps.long.  The MACH group provides haplotypes as two long strings of nucleotide codes per individual.
使用read.snps.long。马赫组提供作为每个个体的核苷酸编码的两个长串的单体型。


值----------Value----------

an instance of SnpMatrix-class     
一个SnpMatrix-class的实例


作者（S）----------Author(s)----------



VJ Carey




举例----------Examples----------


smhapf = system.file("machHap/c20small.hap.gz", package="GGtools")
snidf = gzfile(system.file("machHap/chr20.snps.gz", package="GGtools"))
snids = scan(snidf, "")
sm = mrefhap2sm( smhapf, snids )
sm

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