R语言 GGtools包 makeCommonSNPs()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

makeCommonSNPs(GGtools)
makeCommonSNPs()所属R语言包：GGtools

                                         confine the SNPs (in multiple chromosomes) in all elements of a list of smlSets to the largest shared subset per chromosome;
                                         局限于smlSets最大子集，每个染色体的共享列表的所有元素的单核苷酸多态性（多个染色体）;

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

confine the SNPs (in multiple chromosomes) in all elements of a list of smlSets to the largest shared subset per chromosome; test for satisfaction of this condition
限制在smlSets最大子集，每个染色体的共享列表所有元素的SNPs（多个染色体）;这种状况的满意度试验


用法----------Usage----------


makeCommonSNPs(listOfSms)
checkCommonSNPs(listOfSms)



参数----------Arguments----------

参数：listOfSms
an R list with each element consisting of a smlSet-class  
与每一个smlSet-class组成元素的R列表


Details

详情----------Details----------

intersection of set of rsids per chromosome is computed over all elements
一套每个染色体rsids的交点计算的所有元素


值----------Value----------

list of smlSet instances sharing all SNP on all chromosomes
列表中的所有染色体上所有的SNP smlSet共享实例


作者（S）----------Author(s)----------



VJ Carey <stvjc@channing.harvard.edu>




举例----------Examples----------


data(smlSet.example)
tmp = smList(smlSet.example)[[1]]
tmp = tmp[,-c(20:40)]
newe = new.env()
assign("smList", list(`21`=tmp), newe)
ex2 = smlSet.example
ex2@smlEnv = newe
try(checkCommonSNPs(list(smlSet.example,ex2)))
list2 = makeCommonSNPs( list(smlSet.example, ex2) )
checkCommonSNPs(list2)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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