parseGEO(GEOquery)
parseGEO()所属R语言包:GEOquery
Parse GEO text
解析GEO文本
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Workhorse GEO parsers.
主力GEO解析器。
用法----------Usage----------
parseGEO(fname, GSElimits)
parseGPL(fname)
parseGDS(fname)
parseGSE(fname, GSElimits)
parseGSM(fname)
参数----------Arguments----------
参数:fname
The filename of a SOFT format file. If the filename ends in .gz, a gzfile() connection is used to read the file directly.
软格式的文件的文件名。如果文件名结束。GZ,gzfile()连接直接读取文件。
参数:GSElimits
Used to limit the number of GSMs parsed into the GSE object; useful for memory management for large GSEs.
用来限制GSMS解析到GSE对象的数量;大两房的内存管理非常有用。
Details
详情----------Details----------
These are probably not useful to the end-user. Use getGEO to access these functions. parseGEO simply delegates to the appropriate specific parser. There should be no reason to use the parseGPL, parseGDS, parseGSE, or parseGSM functions directly.
这些可能不是最终用户有用。使用getGEO访问这些功能。 parseGEO只是代表相应的具体解析器。不应该有任何理由直接使用的parseGPL,parseGDS,parseGSE,或parseGSM功能。
值----------Value----------
parseGEO returns an object of the associated type. For example, if it is passed the text from a GDS entry, a GDS object is returned.
parseGEO返回一个相关类型的对象。例如,如果它是通过从GDS条目的文本,一个GDS对象返回。
作者(S)----------Author(s)----------
Sean Davis
参见----------See Also----------
getGEO
getGEO
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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