pos(genoset)
pos()所属R语言包:genoset
Positions for features
功能部件的位置
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Chromosome position of features
染色体位置的功能
参数----------Arguments----------
参数:object
RangedData or GenoSet
RangedData或GenoSet
Details
详情----------Details----------
pos-methods: Get chromsome position of features/ranges. Defined as floor of mean of start and end.
pos-methods:功能/范围的染色体位置。定义为地板的开始和结束的平均值。
值----------Value----------
pos-methods: numeric vector of feature positions within a chromosome
pos-methods:数字向量的染色体内的功能位置
作者(S)----------Author(s)----------
Peter Haverty
举例----------Examples----------
probe.names = letters[1:10]
gs = GenoSet(
locData=RangedData(ranges=IRanges(start=1:10,width=1,names=probe.names),space=c(rep("chr1",4),rep("chr3",2),rep("chrX",4)),universe="hg18"),
cn=matrix(31:60,nrow=10,ncol=3,dimnames=list(probe.names,test.sample.names)),
pData=data.frame(matrix(LETTERS[1:15],nrow=3,ncol=5,dimnames=list(test.sample.names,letters[1:5]))),
annotation="SNP6"
)
pos(gs) # 1:10[1:10]
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|