R语言 genoset包 gcCorrect()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gcCorrect(genoset)
gcCorrect()所属R语言包：genoset

                                        cgCorrect
                                         cgCorrect

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Correct copy number for GC content
GC含量的正确拷贝数


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：ds
numeric matrix of copynumber or log2ratio values, samples in columns
数字矩阵copynumber或log2ratio值，列样本


参数：gc
numeric vector, GC percentage for each row of ds, must not have NAs
GC的DS的每一行的百分比，数字向量，必须有NAS


参数：retain.mean
logical, center on zero or keep same mean?
逻辑，中心零或保持相同的平均值？


Details

详情----------Details----------

Copy number estimates from various platforms show "Genomic Waves" (Diskin et al., Nucleic Acids Research, 2008) where copy number trends with local GC content. This function regresses copy number on GC percentage and removes the effect (returns residuals). GC content should be smoothed along the genome in wide
从各种平台上的拷贝数估计表明“基因组波”（迪斯等，核酸研究，2008年），副本数量与当地的GC含量的趋势。此功能退化的GC％的拷贝数和删除的效果（回报残差）。基因组GC含量应平滑，沿宽


值----------Value----------

numeric matrix, residuals of ds regressed on gc
DS的数字矩阵，残差回归的GC


作者（S）----------Author(s)----------


Peter M. Haverty



举例----------Examples----------


ds = rnorm(100) + (0.1 * gc)

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注：
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