R语言 genoset包 bafset-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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bafset-class(genoset)
bafset-class()所属R语言包：genoset

                                        BAFSet class
                                         BAFSet类

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A BAFSet is and extension of GenoSet that requires 'baf' and 'lrr' assayData element
的一个BAFSet是和的GenoSet扩展需要“BAF”和“LRR assayData元素


延伸----------Extends----------

GenoSet
GenoSet


作者（S）----------Author(s)----------


Peter M. Haverty



参见----------See Also----------

bafset-class, cnset-class
bafset级，cnset级


举例----------Examples----------


## Creating a BAFSet[＃创建1 BAFSet]
test.sample.names = LETTERS[11:13]
probe.names = letters[1:10]
locData.rd = RangedData(ranges=IRanges(start=c(1,4,3,2,5:10),width=1,names=probe.names),space=c(rep("chr1",4),rep("chr3",2),rep("chrX",4)),universe="hg18")
bs = BAFSet(
  locData=locData.rd,
  lrr=matrix(1:30,nrow=10,ncol=3,dimnames=list(probe.names,test.sample.names)),
  baf=matrix(31:60,nrow=10,ncol=3,dimnames=list(probe.names,test.sample.names)),
  pData=data.frame(matrix(LETTERS[1:15],nrow=3,ncol=5,dimnames=list(test.sample.names,letters[1:5]))),
  annotation="SNP6"
)

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