R语言 Genominator包 yeastAnno()函数中文帮助文档(中英文对照)

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yeastAnno(Genominator)
yeastAnno()所属R语言包：Genominator

                                         Example datasets from Genominator
                                         从Genominator范例集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

3 example datasets from Genominator; 2 contain annotation information from yeast and 1 contain actual data from yeast as well.  A bigger dataset is available in the experimental data package yeastRNASeq.
3从Genominator例如数据集; 2包含注释信息，从酵母和1包含实际数据以及从酵母。一个更大的数据集是在实验数据包yeastRNASeq。


用法----------Usage----------


data(yeastAnno)
data(yeastAnno.sources)
data(chr1_yeast)



格式----------Format----------

yeastAnno is a data frame with 7124 observations on the following 5 variables: chr, start, end, strand, gene_biotype.
yeastAnno是在以下5个变量与7124观测的数据框：chr，start，end，strand，gene_biotype。

yeastAnno.sources is a list with four components names ensembl.gene, ensembl.transcript, ucsc.sgdGene, ucsc.ensGene containing annotation on yeast from 2 different sources (Ensembl and UCSC), each sources has two different queries (one gene-level, one transcript-level).  The annotation was obtained in January 2010 and should not be used for analysis.
yeastAnno.sources是一个有四个组件名称列表ensembl.gene，ensembl.transcript，ucsc.sgdGene，ucsc.ensGene在酵母中含有从2个不同的来源（Ensembl的和加州大学圣克鲁兹分校），每个注解来源有两个不同的查询（一个基因，一个誊本级）。在2010年1月获得了注解，不应该被用于分析。

chr1_yeast is a data frame containing mock data in yeast from two different samples (labelled mRNA_1 and mRNA_2), linked to distinct genomic locations.  There may be several data values linked to each genomic location.
chr1_yeast是从两个不同的样本含在酵母中的模拟数据（数据框标记mRNA_1和mRNA_2），链接到不同基因组的位置。可能有多个数据值与每个基因的位置。


源----------Source----------

Ensembl and UCSC January 2010.
ENSEMBL和加州大学圣克鲁兹分校2010年1月。


参见----------See Also----------

There is a discussion of the yeastAnno.sources in the withShortRead vignette.
有一个yeastAnno.sources插曲withShortRead在讨论。


举例----------Examples----------


data(yeastAnno)
head(yeastAnno)
data(yeastAnno.sources)
names(yeastAnno.sources)
head(yeastAnno.sources$ensembl.gene)
data(chr1_yeast)
head(chr1_yeast)

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