R语言 genomes包 enaSRA()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

enaSRA(genomes)
enaSRA()所属R语言包：genomes

                                         ENA sequence read archive  
                                         ENA的顺序读取存档

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Search for SRA samples at the ENA using a taxonomy name or id
搜寻ENA的SRA使用分类名称或ID的样品


用法----------Usage----------


enaSRA(tax, limit = 5000)



参数----------Arguments----------

参数：tax
a taxonomy ID or name  
分类编号或名称


参数：limit
total number of samples to return  
总样本数返回


Details

详情----------Details----------

Searches the sra_sample data from the taxonomy portal at ENA.
从ENA分类门户搜索sra_sample数据。


值----------Value----------

a data.frame listing SRA samples
数据框上市储备金帐户样品


注意----------Note----------

URL strings at ENA require a taxonomy ID, so searching by name
在ENA的URL字符串需要分类编号，按名称搜索


作者（S）----------Author(s)----------


Chris Stubben



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   <code>sra</code> for all microbial SRA samples and a description of columns.  Also

举例----------Examples----------


# chimps[黑猩猩]
pan&lt;-enaSRA(9596)   # or pan&lt;-enaSRA("Pan")[或泛<enaSRA（“潘”）]
head(pan)
nrow(pan)
table2(pan$center)
bases(sum(pan$bases, na.rm=TRUE))
bases(sum(pan$reads, na.rm=TRUE), round=1)


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。