complete(genomes)
complete()所属R语言包：genomes
Complete microbial genome dates
完整的微生物基因组日期
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Dates associated with complete microbial genomes at NCBI
在NCBI完整的微生物基因组相关的日期
用法----------Usage----------
data(complete)
格式----------Format----------
A data frame with 1787 observations on the following 11 variables.
与1787在以下11个变量的观测数据框。
pid genome project id
pid基因组项目的ID
name taxonomy name
name分类名称
released release date in the lproks table
releasedlproks表发布日期
genbank genbank ID of the largest chromosome from
genbankGenBank中编号最大的染色体
history the revision history date associated with the
history修订历史记录日期与
submitted the submission date associated with the genbank ID
submitted与GenBank ID提交日期
pmid pubmed ID of genome paper from the comma-separated list
pmid医学基因纸编号，由逗号分隔的列表
published the published date of the pubmed ID
published期刊编号发布日期
wgs the WGS accession, if previously released as an assembly
wgs的WGS加入，如果以前发布的集会
assembled the assembly release date
assembled大会发布日期
source likely source of the lproks release
sourcelproks释放可能的来源
Details
详情----------Details----------
This table was created to check release dates in the lproks table. The revision history date was added using ncbiRelease, the submission date using ncbiSubmit, and publication date using the pub dataset. Currently, 178 complete genomes are mislabeled with the assembly release date (out of 473 that were previously released as an assembly) , the source for 204 others is unknown. and many of the first genomes released report "published" dates.
这是创建表检查lproks表的发行日期。修订历史记录日期被添加使用ncbiRelease使用ncbiSubmit，出版日期，使用pub集，提交日期。目前，178个完整的基因组大会发布日期标示错误（先前作为大会发布的473），204人的来源不明。和许多的第一个基因组公布的报告“出版”的日期。
源----------Source----------
See http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/WGS/WGSprojectlist.cgi for a list of the 473 assembly projects superceded by a complete genome sequence.
看到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/WGS/WGSprojectlist.cgi为473装配项目列表由一个完整的基因组序列所取代。
举例----------Examples----------
data(complete)
# some early genomes use published dates from the wrong paper (eg, 2nd and 4th genomes below) [一些早期的基因组使用错误的纸张出版日期（例如，下面的第2和第4的基因组）]
complete[1:5, ]
# likely source of release dates [发布日期可能源]
table2(complete$source)
# genomes previously submitted as WGS[以前提交的WGS的基因组]
table(is.na(complete$wgs))
subset(complete, !is.na(wgs))[1:2,]
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发表于 2012-2-25 19:21:31
