R语言 genomeIntervals包 getGffAttribute()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getGffAttribute(genomeIntervals)
getGffAttribute()所属R语言包：genomeIntervals

                                        Pull one or more key/value pairs from gffAttributes strings
                                         拉gffAttributes字符串的一个或多个键/值对

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

GFF files contain a string, with key/value pairs separated by “;”, and the key and value separated by “=”. This function quickly extracts one or more key/value pairs.
GFF文件包含一个字符串，分隔的键/值对的“;”，“=”分隔键和值。此功能快速提取一个或多个键/值对。


用法----------Usage----------


getGffAttribute(gi, attribute)



参数----------Arguments----------

参数：gi
A Genome_intervals object.
一个Genome_intervals对象。


参数：attribute
A vector of key names.
键名的向量。


值----------Value----------

A matrix with the same number of rows as gi, and one column per element of attribute.
与gi，每一个元素attribute列相同数量的行矩阵。


参见----------See Also----------

See parseGffAttributes for more complete parsing. See the function readGff3 for loading a GFF file.
看到parseGffAttributes更完整的分析。看到功能readGff3加载GFF文件。


举例----------Examples----------



# Get file path[获取文件路径]
libPath <- installed.packages()["genomeIntervals", "LibPath"]
filePath <- file.path(
                   libPath,
                   "genomeIntervals",
                   "example_files"
                   )

# Load gff[加载GFF]
gff <- readGff3( file.path( filePath, "sgd_simple.gff"), isRightOpen=FALSE)

## head of full gff annotations[＃全GFF注释头]
head(annotation(gff))

# extract ID and Parent attributes[提取ID和父属性]
idpa = getGffAttribute( gff, c( "ID", "Parent" ) )

head(idpa)



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