R语言 GenomeGraphs包 makeGeneRegion()函数中文帮助文档(中英文对照)

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makeGeneRegion(GenomeGraphs)
makeGeneRegion()所属R语言包：GenomeGraphs

                                        Creates an object of class Gene containing the intron-exon structures of genes
                                         创建一个含有基因的内含子 - 外显子的结构基因类的对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creates an object of class Gene containing the intron-exon structures of genes. Given a start and end position, strand and chromosome, all the intron-exon strcutures of all genes laying in this region will be retrieved.
创建一个类，包含基因的内含子 - 外显子结构基因的对象。鉴于一个开始和结束的位置，钢绞线和染色体，铺设在这一区域的所有基因的内含子 - 外显子strcutures将检索。


用法----------Usage----------


makeGeneRegion(start, end, chromosome, strand, biomart, dp = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：start
Start position on chromosome
启动染色体上的位置


参数：end
End position on chromosome
对染色体的末端位置


参数：chromosome
Chromosome name
染色体的名字


参数：strand
Strand either + or -
斯特兰德+或 -


参数：biomart
Mart object, created by the useMart function of biomaRt
沃尔玛对象，创建由biomaRt useMart功能


参数：dp
Object of class DisplayPars, determines the display of features on the plot
类DisplayPars对象，决定对图显示功能


值----------Value----------

An object of class Gene
一个对象的类基因


作者（S）----------Author(s)----------


Steffen Durinck and Jim Bullard



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


##---- Should be DIRECTLY executable !! ----[＃----应直接执行！！ ----]
##-- ==&gt;  Define data, use random,[ -  ==>定义数据，使用随机的，]
##--        or do  help(data=index)  for the standard data sets.[＃ - 或做帮助的标准数据集（数据索引）。]

## The function is currently defined as[＃函数定义为]
function (start, end, chromosome, strand, biomart, dp = NULL)
{
    if (missing(start))
        stop("Need to specify a start for creating a GeneRegion")
    pt <- getClass("GeneRegion")@prototype
    if (is.null(dp))
        dp <- pt@dp
    if (is.numeric(chromosome))
        chromosome = as.character(chromosome)
    new("GeneRegion", start = start, end = end, chromosome = chromosome,
        strand = strand, biomart = biomart, dp = dp)
  }

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