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R语言 GeneticsPed包 geneContribution()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 19:06:41 | 显示全部楼层 |阅读模式
geneContribution(GeneticsPed)
geneContribution()所属R语言包:GeneticsPed

                                        Gene contribution or proportion of genes in pedigree by individual
                                         或在血统基因的比例由个人基因贡献

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

geneContribution calculates gene contribution as proportion of genes in pedigree by individual with higher number of descendants will have higher values.
geneContribution计算个别的基因家系的基因比例的贡献,具有较高的后代数量将有更高的价值。


用法----------Usage----------


geneContribution(x, relative=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:x
pedigree
系谱


参数:relative
logical, should results be presented relative to number of individuals in the pedigree
逻辑,应该结果提出相对一些个人的系谱


值----------Value----------

Gene contribution values i.e. higher the values higher the contribution of genes by particular individual in the pedigree. When relative=FALSE, values represent number of individuals (in conceptually additive manner i.e. 0.5 + 0.75 = 1.25 individual) in the pedigree that carry genes of a particular individual. With relative=TRUE, values represent the same result as ratios to all individuals in the pedigree. Value 0 indicates that individual did not pass its genes to next generations.
基因的贡献值,即较高的高值特别是个体的谱系基因的贡献。当relative=FALSE,值代表在某一个人的基因谱系,进行个人概念添加剂的方式,即0.5 + 0.75 = 1.25个人。用relative=TRUE,值代表的谱系中的所有个人比例相同的结果。值0表示,个别没有通过其下一代的基因。


作者(S)----------Author(s)----------


Gregor Gorjanc



参见----------See Also----------

Pedigree
Pedigree


举例----------Examples----------


  ped <- generatePedigree(nId=5, nGeneration=4, nFather=1, nMother=2)
  geneContribution(ped)
  geneContribution(ped, relative=FALSE)
  ## geneContribution(ped[5:15, ]) ## needs [ method[geneContribution#(PED [5:15])##需要[方法]

  ## More than one father example[#更多比一个父亲的例子]
  ped <- data.frame(     id=c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7),
                    father1=c(0, 0, 0, 2, 1, 1, 2),
                    father2=c(0, 0, 0, 0, 0, 2, 0),
                     mother=c(0, 0, 0, 0, 3, 3, 3),
                    generat=c(1, 1, 1, 2, 2, 2, 2))
  ped <- Pedigree(ped, ascendant=c("father1", "father2", "mother"),
                  ascendantSex=c(1, 1, 2), ascendantLevel=c(1, 1, 1),
                  unknown=0, generation="generat")
  geneContribution(ped)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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