R语言 GeneSelector包 AggregateSimple()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

AggregateSimple(GeneSelector)
AggregateSimple()所属R语言包：GeneSelector

                                        Simple aggregation of repeated rankings
                                         重复排名的简单聚合

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

All obtained rankings are aggregated by a genewise summary measure.
所有获得的排名是由1 2-6。总结measure汇总。


用法----------Usage----------


  AggregateSimple(RR, measure = c("mode", "mean", "trimmed.mean", "median", "quantile"), q=NULL, trim = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：RR
An object of class RepeatedRanking
一个对象的类RepeatedRanking


参数：measure
The statistic to be used as basis for the aggregated ranking.     
用作统计汇总排名的基础上。

modeThe rank occuring most frequently. If several ranks occur equally often, the lowest one is used.  
modeThe排名易出现最频繁的。如果有几个队伍同样经常发生，使用最低的国家之一。

meanThe mean of the ranks.  
meanThe意味着队伍。

trimmed.meanThe trimmed mean of the ranks, i.e. the mean resulting when throwing away the trim*100 percent most extreme observations at both tails.  
trimmed.meanThe修剪意味着队伍，即平均扔掉两个尾巴trim* 100％，最极端的意见时。

medianThe median of the ranks.  
medianThe位数的行列。

quantileThe q-quantile, 0 <= q <= 1, of the ranks.   
quantileTheq-位数，0 <= q <= 1“的行列。


参数：q
Only specified if measure="quantile".
如果measure="quantile"唯一指定的。


参数：trim
s. trimmed.mean.
第trimmed.mean。


值----------Value----------

An object of class AggregatedRanking.
对象类AggregatedRanking。


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Slawski  <br>
Anne-Laure Boulesteix



参见----------See Also----------

RepeatRanking, AggregateSVD, AggregatePenalty, AggregateMC
RepeatRanking，AggregateSVD，AggregatePenalty，AggregateMC


举例----------Examples----------


## Load toy gene expression data[＃加载玩具基因表达数据]
data(toydata)
### class labels[＃＃类的标签]
yy <- toydata[1,]
### gene expression[＃＃基因表达]
xx <- toydata[-1,]
### run RankingTstat[＃运行RankingTstat的]
ordT <- RankingTstat(xx, yy, type="unpaired")
### Generate Leave-one-out Foldmatrix[＃生成留出Foldmatrix]
loo <- GenerateFoldMatrix(y = yy, k=1)
### Get all rankings[＃获取所有排名]
loor_ordT <- RepeatRanking(ordT, loo)
### aggregate rankings[＃总排名]
agg_simple_ordT <- AggregateSimple(loor_ordT, measure ="mean")
toplist(agg_simple_ordT)

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