R语言 geneRecommender包 gr.normalize()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gr.normalize(geneRecommender)
gr.normalize()所属R语言包：geneRecommender

                                        A function for normalization
                                         标准化的函数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

gr.normalize normalizes a matrix of gene expression data as part of the implementation of the Gene Recommender algorithm described in Owen et al (2003).  gr.normalize must be applied to the data before running gr.main.  
gr.normalize标准化基因导购欧文等人（2003年）中描述的算法实施的一部分基因表达数据矩阵。 gr.normalize必须应用于数据之前运行gr.main。


用法----------Usage----------


gr.normalize(unnormalized.dataset)



参数----------Arguments----------

参数：unnormalized.dataset
A matrix or ExpressionSet containing the normalized gene expression data.   The rows correspond to genes, the columns correspond to experiments, and the entries correspond to the gene expression levels.  The rows must be labeled.     
一个矩阵或ExpressionSet的，规范化的基因表达数据。列对应的行对应的基因，实验，和条目对应的基因表达水平。必须标明的行。


Details

详情----------Details----------

gr.normalize normalizes the data so that for each gene, the gene expression measurements are distributed uniformly between  -1 and 1.  
gr.normalize规范化，使每一个基因，该基因表达测量分布-1和1之间均匀的数据。


值----------Value----------

The normalized gene expression data, in the same format as the input.  
规范化的基因表达数据，在相同的格式作为输入。


作者（S）----------Author(s)----------



Gregory J. Hather <a href="mailto:ghather@stat.berkeley.edu">ghather@stat.berkeley.edu</a> <br>
with contributions from from Art B. Owen <a href="mailto:art@stat.stanford.edu">art@stat.stanford.edu</a><br>
and Terence P. Speed <a href="mailto:terry@stat.berkeley.edu">terry@stat.berkeley.edu</a>.  




参考文献----------References----------

A Gene Recommender Algorithm to Identify Coexpressed Genes in C. elegans.   Genome Research 13:1828-1837, 2003.  

参见----------See Also----------

gr.main, gr.cv
gr.main, gr.cv


举例----------Examples----------


#This example uses the geneData dataset from the Biobase package[这个例子使用BIOBASE包geneData集]
data(geneData)
my.query <- c("31730_at", "31331_at", "31712_at", "31441_at")
normalized.data <- gr.normalize(geneData)

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