R语言 GeneMeta包 CountPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

CountPlot(GeneMeta)
CountPlot()所属R语言包：GeneMeta

                                         Plots for Meta-analysis of gene expression data.
                                         图的基因表达数据的Meta分析。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots for meta-analysis
图的荟萃分析


用法----------Usage----------


IDRplot(m,CombineExp=1length(grep("zSco_Ex",colnames(m)))),colPos="black",colNeg="red",pchPos="*",pchNeg="*",type="b",ylab="IDR",xlab="z threshold",...)
CountPlot(kkk,cols,Score=c("FDR","zSco"),kindof=c("two.sided","pos","neg"),type="b",pch="*",ylab="Number of genes",xlab="FDR threshold",CombineExp=1(ncol(m)-6)/2-1) ,...)



参数----------Arguments----------

参数：m
result matrix of the function zScores
结果矩阵的功能zScores


参数：type
plot parameter
图参数


参数：ylab
plot parameter
图参数


参数：xlab
plot parameter
图参数


参数：pch
plot parameter
图参数


参数：colPos
color for positive z scores
颜色正z分数


参数：colNeg
color for negative z scores
颜色为负z分数


参数：pchPos
symbol for positive z scores
符号为正z分数


参数：pchNeg
symbol for negative z scores
符号为负z分数


参数：CombineExp
vector of integer- which experiments should be combined-default:all experiments
向量整数实验应该联合默认：所有实验


参数：kkk
result object of function zScoreFDR
结果对象功能zScoreFDR的


参数：cols
vector of cols, one for each experiment, and one for the combination
向量COLS，每个实验和组合之一


参数：Score
should the FDR or the zScore be plotted
应FDR的zScore的绘制


参数：kindof
"pos", "neg" or "two.sided"
“POS”，“负”或“two.sided”


参数：...
additional plot parameter
额外的地积参数


Details

详情----------Details----------

IDRplot produces a plot described in Choi et al.
IDRplot生产Choi等人描述了一个图。


作者（S）----------Author(s)----------


M.Ruschhaupt



参考文献----------References----------


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。