R语言 genefu包 scmgene.robust()函数中文帮助文档(中英文对照)

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scmgene.robust(genefu)
scmgene.robust()所属R语言包：genefu

                                         Subtype Clustering Model using only ESR1, ERBB2 and AURKA genes for identification of breast cancer molecular subtypes
                                         只有ESR1，ERBB2和AURKA基因的乳腺癌分子亚型鉴定亚型聚类分析模型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

List of parameters defining the Subtype Clustering Model as published in Wirapati et al 2009 and Desmedt et al 2008 but using single genes instead of gene modules.
发表在Wirapati等2009年和Desmedt等，但使用单一的基因，而不是基因模块的定义亚型聚类分析模型的参数。


用法----------Usage----------


data(scmgene.robust)



格式----------Format----------

List of parameters for SCMGENE:
名单参数SCMGENE：




parameters  List of parameters for the mixture of three Gaussians (ER-/HER2-, HER2+ and ER+/HER2-) that define the Subtype Clustering Model. The structure is the same than for an Mclust object.
parameters参数列表为三个高斯混合（ER-/HER2-，HER2的+和ER + / HER-2），确定亚型聚类分析模型。结构比Mclust对象是相同的。




cutoff.AURKA  Cutoff for AURKA module score in order to identify ER+/HER2- High Proliferation (aka Luminal B) tumors and ER+/HER2- Low Proliferation (aka Luminal A) tumors.
cutoff.AURKA截止AURKA模块得分，以确定的ER + / HER-2高（又名管腔）增殖的肿瘤，ER + / HER-2低（又名Luminal A型）肿瘤增殖。




mod  ESR1, ERBB2 and AURKA modules.
modESR1，ErbB2和AURKA模块。


源----------Source----------

http://clincancerres.aacrjournals.org/content/14/16/5158.abstract?ck=nck



参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


data(scmgene.robust)
str(scmgene.robust, max.level=1)

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注：
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