R语言 genefilter包 rowROC-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

rowROC-class(genefilter)
rowROC-class()所属R语言包：genefilter

                                        Class "rowROC"
                                         类“rowROC”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A class to model ROC curves and corresponding area under
类模型ROC曲线及相应的面积，


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("rowROC", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("rowROC", ...)。


插槽----------Slots----------




data: Object of class "matrix" The input data.
data类"matrix"输入数据的对象。




ranks: Object of class "matrix" The ranked
ranks：Object类的"matrix"排名




sens: Object of class "matrix" Matrix of
sens：Object类的"matrix"矩阵




spec: Object of class "matrix" Matrix of
spec：Object类的"matrix"矩阵




pAUC: Object of class "numeric" The partial
pAUC：Object类的"numeric"部分




AUC: Object of class "numeric" The total area
AUC类"numeric"总面积对象




factor: Object of class "factor" The factor
factor类"factor"因素对象




cutpoints: Object of class "matrix" The values of the cutpoints at which specificity ans sensitivity was calculated. (Note: the data is ranked prior to computation
cutpoints类"matrix"的计算特异性ANS灵敏度的切点值的对象。 （注：数据排名前计算




caseNames: Object of class "character" The
caseNames类"character"：对象




p: Object of class "numeric" The limit to which
p类"numeric"限制对象


方法----------Methods----------




show signature(object="rowROC") Print nice info
显示signature(object="rowROC")打印好的信息




[ signature(x="rowROC", j="missing") Subset the
[signature(x="rowROC", j="missing")子集




plot signature(x="rowROC", y="missing") Plot the ROC curve of the first row of the object along with the pAUC. To plot the curve for a specific row/gene subsetting should be done
图signature(x="rowROC", y="missing")绘制对象沿着与pAUC的第一行的ROC曲线。要绘制一个特定的行/基因子集的曲线应做




pAUC signature(object="rowROC", p="numeric", flip="logical") Integrate area under the curve from 0 to p. This method
pAUCsignature(object="rowROC", p="numeric", flip="logical")集成曲线下从0p面积。这种方法




AUC signature(object="rowROC") Integrate total area under the curve. This method returns a new
联合自卫军signature(object="rowROC")集成曲线下的总面积。此方法返回一个新的




sens signature(object="rowROC") Accessor method for
SENSsignature(object="rowROC")存取方法




spec signature(object="rowROC") Accessor method for
规范signature(object="rowROC")存取方法




area signature(object="rowROC", total="logical") Accessor method for
面积signature(object="rowROC", total="logical")存取方法


作者（S）----------Author(s)----------


Florian Hahne <fhahne@fhcrc.org>



参考文献----------References----------

Schummer M.: Selecting differentially expressed genes from microarray

参见----------See Also----------

rowpAUCs
rowpAUCs


举例----------Examples----------


library(Biobase)
require(genefilter)
data(sample.ExpressionSet)
roc <- rowpAUCs(sample.ExpressionSet, "sex", p=0.5)
roc
area(roc[1:3])

if(interactive()) {
par(ask=TRUE)
plot(roc)
plot(1-spec(roc[1]), sens(roc[2]))
par(ask=FALSE)
}

pAUC(roc, 0.1)
roc

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。