R语言 genefilter包 rejection_plot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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rejection_plot(genefilter)
rejection_plot()所属R语言包：genefilter

                                         Plot rejections vs. p-value cutoff
                                         图拒绝与p值截止

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot the number, or fraction, of null hypotheses rejected as a function of the p-value cutoff. Multiple sets of p-values are accepted, in a list or in the columns of a matrix, in order to permit comparisons.
画出的数量，或者拒绝零假设p值的截止功能的一小部分。 p值的多套被接受，在列表或矩阵列，以允许比较。


用法----------Usage----------


rejection_plot(
               p,
               col, lty = 1, lwd = 1,
               xlab = "Cutoff", ylab = "Rejections",
               xlim = c(0, 1), ylim,
               legend = names(p),
               at = c("all", "sample"),
               n_at = 100,
               probability = FALSE,
               ...
               )



参数----------Arguments----------

参数：p
The p-values to be used for plotting. These may be in the columns of a matrix, or in the elements of a list. One curve will be generated for each column/element, and all NA entries will be dropped. If column or element names are supplied, they are used by default for a plot legend.  
绘图的P-值。这可能是一个矩阵的列，或在列表中的元素。将生成一条曲线，每列/元素，所有的NA条目将被丢弃。如果提供列名或元素名，他们都默认使用的图例。


参数：col
Colors to be used for each curve plotted. Recycled if necessary. If col is omitted, rainbow is used to generate a set of colors.  
每个曲线的颜色绘制。回收，如果必要。 col如果省略，rainbow用来生成一组颜色。


参数：lty
Line styles to be used for each curve plotted. Recycled if necessary.  
每个曲线的线样式绘制。回收，如果必要。


参数：lwd
Line widths to be used for each curve plotted. Recycled if necessary.  
每个曲线的线路宽度绘制。回收，如果必要。


参数：xlab
X-axis text label.  
X轴的文本标签。


参数：ylab
Y-axis text label.  
Y轴的文本标签。


参数：xlim
X-axis limits.  
X轴限制。


参数：ylim
Y-axis limits.  
Y轴的限制。


参数：legend
Text for legend. Matrix column names or list element names (see p above) are used by default. If NULL, no legend is plotted.  
为传说中的文本。矩阵的列名或列表中的元素名称（见p以上）默认情况下使用。如果NULL绘制，没有传说中。


参数：at
Should step functions be plotted with a step at every value in p, or should linear interpolation be used at a sample of points spanning xlim? The latter looks when there are many p-values.  
应加强功能被绘制与p值在每一步，还是应该使用线性插值法在样本点的跨越xlim？后者看起来有很多的p值。


参数：n_at
When at = "sample" is given, how many sample points should be used for interpolation and plotting?  
当at = "sample"，多少个采样点应用于插值和绘图？


参数：probability
Should the fraction of null hypotheses rejected be reported instead of the count? See the probability argument to hist.   
应该拒绝虚无假设的分数报告，而不是计数？看到probabilityhist参数。


参数：...
Other arguments to pass to the plot call which sets up the axes. Note that the ... argument will not be passed to the lines calls which actually generate the curves.  
其他参数传递给plot呼叫设立轴。请注意，...参数不会被传递到lines调用实际生成的曲线。


值----------Value----------

A list of the step functions used for plotting is returned invisibly.
绘图用的步骤功能的列表，则返回无形。


作者（S）----------Author(s)----------


Richard Bourgon <bourgon@ebi.ac.uk>



举例----------Examples----------


# See the vignette: Diagnostic plots for independent filtering[看到小插曲：独立筛选诊断图]

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