findLargest(genefilter)
findLargest()所属R语言包:genefilter
Find the Entrez Gene ID corresponding to the largest statistic
找到相应的最大统计Entrez基因ID
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Most microarrays have multiple probes per gene (Entrez). This function finds all replicates, and then selects the one with the largest value of the test statistic.
大多数芯片有多个基因探针(Entrez的)。此功能发现所有复制,然后选择与检验统计量最大的价值之一。
用法----------Usage----------
findLargest(gN, testStat, data = "hgu133plus2")
参数----------Arguments----------
参数:gN
A vector of probe identifiers for the chip.
芯片的探针标识符的向量。
参数:testStat
A vector of test statistics, of the same length as gN with the per probe test statistics.
向量的长度相同的测试统计,gN每探针测试统计。
参数:data
The character string identifying the chip.
字符串识别芯片。
Details
详情----------Details----------
All the probe identifiers, gN, are mapped to Entrez Gene IDs and the duplicates determined. For any set of probes that map to the same Gene ID, the one with the largest test statistic is found. The return vector is the named vector of selected probe identifiers. The names are the Entrez Gene IDs.
所有探针标识,gN,映射到Entrez基因标识和重复的决心。对于任何一组映射到相同的基因ID的探针,发现一个最大的检验统计。返回向量选定探针标识符命名的向量。的名称是Entrez基因标识。
This could be extended in different ways, such as allowing the user to use a different selection criterion. Also, matching on different identifiers seems like another alternative.
以不同的方式,如允许用户使用不同的选择标准,这可以延长。此外,在不同的标识符匹配好像另一种选择。
值----------Value----------
A named vector of probe IDs. The names are Entrez Gene IDs.
一个探针的ID命名的向量。的名称是Entrez基因标识。
作者(S)----------Author(s)----------
R. Gentleman
参见----------See Also----------
sapply
sapply
举例----------Examples----------
library("hgu95av2.db")
set.seed(124)
gN <- sample(ls(hgu95av2ENTREZID), 200)
stats <- rnorm(200)
findLargest(gN, stats, "hgu95av2")
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