coxfilter(genefilter)
coxfilter()所属R语言包:genefilter
A filter function for univariate Cox regression.
一个单变量Cox回归的过滤功能。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A function that performs Cox regression with bindings for surt, cens, and p is returned. This function filters genes according to the attained p-value from a Cox regression using surt as the survival times, and cens as the censoring indicator. It requires survival.
执行surt,cens,p绑定Cox回归函数返回。此功能根据Cox回归达到p值使用surt的生存时间,和cens作为审查指标筛选基因。需要survival。
用法----------Usage----------
coxfilter(surt, cens, p)
参数----------Arguments----------
参数:surt
Survival times.
存活时间。
参数:cens
Censoring indicator.
截尾的指标。
参数:p
The p-value to use in filtering.
p值使用的过滤。
值----------Value----------
Calls to the coxph function in the survival library are used to fit a Cox model. The filter function returns TRUE if the p-value in the fit is less than p.
coxphsurvival库函数调用用来适应Cox模型。过滤函数返回TRUE如果在合适的p值比p少。
作者(S)----------Author(s)----------
R. Gentleman
参见----------See Also----------
Anova
Anova
举例----------Examples----------
set.seed(-5)
sfun <- coxfilter(rexp(10), ifelse(runif(10) < .7, 1, 0), .05)
ffun <- filterfun(sfun)
dat <- matrix(rnorm(1000), ncol=10)
out <- genefilter(dat, ffun)
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