R语言 GeneAnswers包 topCategory()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

topCategory(GeneAnswers)
topCategory()所属R语言包：GeneAnswers

                                         Present top enrichment test information
                                         目前浓缩试验信息

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to present top enichmentInfo of given GeneAnswers instance.
运作提出给予GeneAnswers实例的顶端enichmentInfo。


用法----------Usage----------


topCategory(inputX, orderby = c("geneNum", "pvalue", "foldChange", "oddsRatio", "correctedPvalue"), top = 5, file = FALSE, fileName = "topCategory.txt")



参数----------Arguments----------

参数：inputX
a given GeneAnswers instance  
一个给定的GeneAnswers实例


参数：orderby
type to sort enrichmentInfo slot  
键入排序enrichmentInfo插槽


参数：top
integer to specify how many top rows to be presented  
整数来指定多少顶行提交


参数：file
logic value to determine whether save to a file  
逻辑值，以确定是否保存到一个文件


参数：fileName
string to specify file name, default file name is topCategory.txt
字符串指定文件名，默认的文件名是topCategory.txt


Details

详情----------Details----------

orderby could be one of 'geneNum', 'pvalue', 'foldChange', 'oddsRatio' and 'correctedPvalue'. top could be an integer or 'ALL'. The top former specified categories will be printed on screen while only 30 categories will be displayed for 'ALL'. All categories can be saved in a specified file.
的OrderBy可能是一个“geneNum，pvalue”，“foldChange，oddsRatio和correctedPvalue”。顶部可能是一个整数或“ALL”。顶部前指定的类别将打印在屏幕上，将显示为“ALL”，而只有30类。所有类别可以保存在一个指定的文件。


值----------Value----------

print necessary information on the screen and save into a specified file if request.
打印在屏幕上的必要信息，并保存到指定的文件，如果请求。


作者（S）----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。