R语言 GeneAnswers包 getREACTOMEPATHList()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getREACTOMEPATHList(GeneAnswers)
getREACTOMEPATHList()所属R语言包：GeneAnswers

                                         Retrieve REACTOME path categories containing given genes
                                         检索REACTOME路径类别包含给定的基因

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to retrieve REACTOME path_db IDs containing given genes.
函数检索REACTOME path_db标识包含给定的基因。


用法----------Usage----------


getREACTOMEPATHList(geneVector, lib)



参数----------Arguments----------

参数：geneVector
an Entrez gene IDs vector  
Entrez基因标识矢量


参数：lib
annotation library to be used to retrieve REACTOME path_db IDs IDs.  
要使用注释库检索的REACTOME path_db ID标识。


Details

详情----------Details----------

The current version only supports Bioconductor team maintained annotation libraries, like 'org.Bt.eg.db', 'org.Ce.eg.db', 'org.Cf.eg.edu', 'org.Dm.eg.db', 'org.Dr.eg.db', 'org.EcK12.eg.db', 'org.EcSakai.eg.db', 'org.Gg.eg.db', 'org.Hs.eg.db', 'org.Mm.eg.db', 'org.Rn.eg.db' and 'org.Ss.eg.db'. If the REACTOME service is not available, the function will stop.
当前版本只支持Bioconductor团队保持注释库，像org.Bt.eg.db“，”org.Ce.eg.db，org.Cf.eg.edu“，”org.Dm.eg.db ，org.Dr.eg.db，org.EcK12.eg.db，org.EcSakai.eg.db，org.Gg.eg.db，org.Hs.eg.db ，org.Mm.eg.db，org.Rn.eg.db和org.Ss.eg.db“。 ，如果REACTOME服务不可用，该功能将停止。


值----------Value----------

return a REACTOME genes ID list, names of the list are REACTOME path IDs IDs and elements are gene IDs.
返回REACTOME基因ID列表，列表的名称是REACTOME路径标识ID和元素是基因标识。


作者（S）----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


## Not run: a &lt;- getREACTOMEPATHList(c('8772', '1017'), 'org.Hs.eg.db')[＃无法运行：< -  getREACTOMEPATHList（C（8772，1017），org.Hs.eg.db“）]
## Not run: length(a)[＃不运行：（a）长度]

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