getPATHList(GeneAnswers)
getPATHList()所属R语言包:GeneAnswers
Retrieve KEGG categories containing given genes
检索包含给定的基因KEGG类别
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to retrieve KEGG category IDs containing given genes.
函数来检索包含给定的基因KEGG类别ID。
用法----------Usage----------
getPATHList(geneVector, lib)
参数----------Arguments----------
参数:geneVector
an Entrez gene IDs vector
Entrez基因标识矢量
参数:lib
annotation library to be used to retrieve KEGG IDs.
注释库,可用于检索KEGG的ID。
Details
详情----------Details----------
The current version only supports Bioconductor team maintained annotation libraries, like 'org.Bt.eg.db', 'org.Ce.eg.db', 'org.Cf.eg.edu', 'org.Dm.eg.db', 'org.Dr.eg.db', 'org.EcK12.eg.db', 'org.EcSakai.eg.db', 'org.Gg.eg.db', 'org.Hs.eg.db', 'org.Mm.eg.db', 'org.Rn.eg.db' and 'org.Ss.eg.db'.
当前版本只支持Bioconductor团队保持注释库,像org.Bt.eg.db“,”org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.edu“,”org.Dm.eg.db ,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Hs.eg.db ,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db和org.Ss.eg.db“。
值----------Value----------
return a KEGG genes ID list, names of the list are KEGG IDs and elements are genes IDs.
返回KEGG基因ID列表,列表的名称是KEGG ID和元素是基因标识。
作者(S)----------Author(s)----------
Gang Feng, Pan Du and Simon Lin
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
a <- getPATHList(c('56458', '16590'), 'org.Mm.eg.db')
length(a)
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