readExpData(gage)
readExpData()所属R语言包:gage
Read in expression data
读取数据中的表达
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This is a wrapper function of read.delim for reading in expression data matrix in tab-delimited format.
这是一个制表符分隔的格式表达数据矩阵读read.delim包装函数。
用法----------Usage----------
readExpData(file = "arrayData.txt", ...)
参数----------Arguments----------
参数:file
character string, the full path name to the expression data file in tab-delimited format. Rows are genes, columns are array samples.
字符串,表达制表符分隔的格式的数据文件的完整路径名。行是基因,列阵列样品。
参数:...
other arguments to be passed into read.delim function.
其他参数被传递到read.delim功能。
Details
详情----------Details----------
readExpData is a wrapper function of read.delim. Please check help information of read.delim for more details.
readExpData是read.delim的包装函数。请帮助更多细节信息read.delim。
值----------Value----------
A data.frame (matrix-like) of gene expression data. Rows are genes, columns are array samples.
一个基因表达数据的数据框(矩阵)。行是基因,列阵列样品。
作者(S)----------Author(s)----------
Weijun Luo <luo_weijun@yahoo.com>
参考文献----------References----------
Generally Applicable Gene Set Enrichment for Pathways Analysis. BMC Bioinformatics 2009, 10:161
参见----------See Also----------
readList read in gene set list
readList阅读基因组名单
举例----------Examples----------
filename=system.file("extdata/gse16873.demo", package = "gage")
demo.data=readExpData(filename, row.names=1)
head(demo.data)
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注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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