R语言 flowStats包 normQA()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

normQA(flowStats)
normQA()所属R语言包：flowStats

                                        Normalization quality assessment
                                         规范化的质量评估

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create QA plots for a flow cytometry normalization process.
创建QA流式单元标准化进程的图谋。


用法----------Usage----------


normQA(data, morph = c("^fsc", "^ssc"), channels, odat = NULL, ask = names(dev.cur()) != "pdf", grouping = NULL, tag.outliers = FALSE, peaksOnly = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：data
a normalized flowSet.
归一flowSet。


参数：morph
A character vector of channel names to use for the backgating into the morphological channels.
频道名称的一个特征向量使用backgating到形态渠道。


参数：channels
The channels for which to create plots. Defaults to all normalized channels.
渠道为其创建图。默认全部归渠道。


参数：odat
The original data set, always needed if there are no warping functions available.
原始数据集，总是需要的，如果有没有翘曲功能。


参数：ask
Ask before creating a new plot.
要求，然后再创建一个新的图。


参数：grouping
A grouping variable in data's phenoData slot.
在data的phenoData插槽分组变量。


参数：tag.outliers
Logical. Add sample name to outliers in the plots.
逻辑。样品名称添加到图中的离群。


参数：peaksOnly
Logical. Only use data when a peak was detected in a particular sample. If set to FALSE, a average peak location is estimated.
逻辑。只使用一个高峰是在一个特定样本检测时的数据。如果设置为FALSE，平均峰值位置估计。


Details

详情----------Details----------

This function assumes that the necessary information has been added as attributes to data during the normalization procedure. Depending on the available information, a set of QA plots is generated. Available plots are:
这个函数假设必要的信息已经加入作为data标准化过程中的属性。根据所提供的资料，产生了一套质量保证图。可用的图是：

Amount of peak adjustment
量的高峰期调整

Warping functions
翘曲功能

Landmark classification confidence
具有里程碑意义的分类信心

Backgating of peak events in morphological channels
Backgating的形态渠道高峰事件


值----------Value----------

This function is called for its side effect of generating plots.
此功能被称为图产生的副作用。


作者（S）----------Author(s)----------



Florian Hahne


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注：
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