curvPeaks(flowStats)
curvPeaks()所属R语言包:flowStats
Parse curv1Filter output
解析curv1Filter输出
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Parse the output of curv1Filter and find modes and midpoints of the high-density regions. This function is considered to be internal.
解析curv1Filter的输出和发现模式和高密度区域的中点。此功能被认为是内部的。
用法----------Usage----------
curvPeaks(x, dat, borderQuant = 0.01, n = 201, from, to, densities=NULL)
参数----------Arguments----------
参数:x
A multipleFilterResult produced by a curv1Filter operation.
一个multipleFilterResult生产curv1Filter操作。
参数:dat
The corresponding flowFrame.
相应的flowFrame。
参数:borderQuant
A numeric in [0,1] giving the extreme quantiles for which high-density regions are ignored.
在[0,1]高密度区域被忽略的极端位数的数字。
参数:n, from, to
Arguments are passed on to density.
参数被传递到density。
参数:densities
The optional y values of the density estimate computed for the respective data.
可选的密度估计y值计算相应的数据。
值----------Value----------
A list with items
与项目名单
参数:peaks
x and y locations of the modes of the regions in the density estimates.
x和y位置的密度区域的模式估计。
参数:regions
the left and right margins of the regions.
区域的左,右页边距。
参数:midpoints
the mean of regions.
平均regions。
参数:regPoints
x and y locations of the outline of the significant density regions.
x和y的的显著密度区域的轮廓位置。
参数:densFuns
an approximation function of the density estimate
逼近函数的密度估计
作者(S)----------Author(s)----------
Florian Hahne
参见----------See Also----------
landmarkMatrix
landmarkMatrix
举例----------Examples----------
data(GvHD)
tmp <- filter(GvHD[[10]], curv1Filter("FSC-H"))
res <- flowStats:::curvPeaks(tmp, exprs(GvHD[[10]])[, "FSC-H"])
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