R语言 flowQ包 qaProcess.2DStatsPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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qaProcess.2DStatsPlot(flowQ)
qaProcess.2DStatsPlot()所属R语言包：flowQ

                                          Creates a QA process for 2D summary statistic comparisons across
                                         创建一个2D的汇总统计比较QA流程，跨

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a list of flowSet as input and  creates all necessary output for a '2DStatsPlot' type QA process. Objects created by this function can be laid out as HTML using writeQAReport.
这个函数接受一个flowSet名单作为输入，并创建了所有必要的输出为一个2 DStatsPlot类型的QA流程。由这个函数创建的对象可以作为HTML使用writeQAReport奠定了。


用法----------Usage----------



qaProcess.2DStatsPlot(flowList,dyes=c("FSC-A","SSC-A"),
                          outdir="QAReport",thresh=0.25,func=mean,
                          sum.dimensions=NULL,det.dimensions= NULL,pdf=TRUE,
                          name="2DStats",...)



参数----------Arguments----------

参数：flowList
A list of flowSet  
一个的flowSet列表


参数：dyes
Flow parameters to be compared across multiple samples
流参数进行比较多个样本


参数：outdir
The directory to which the graphical output is to be saved. If multiple QA processes are to be combined, make sure to use the same directory every time.  
图形输出要保存的目录。如果要合并的多个QA流程，确保每次使用相同的目录。


参数：thresh
A numeric value between 0 and 1 which is used as a threshold by the outlier detection algorithm
0和1之间的一个数值，这是作为一个阈值，用于异常检测算法


参数：func
Summary statistic function to be applied to each parameter in a flowFrame (mean,median etc)   
汇总统计功能被应用到每个参数flowFrame（均值，中位数等）


参数：sum.dimensions
The dimensions of summary plot generated in inches, default is NULL where the dimensions are automatically selected
总结图产生英寸的尺寸，默认值为NULL的尺寸自动选择


参数：det.dimensions
the dimensions of each sub image generated by the QA process in inches, default is NULL where the dimensions are automatically selected.  
英寸的QA过程中产生的每个子图像的尺寸，默认值为NULL的尺寸自动选择。


参数：pdf
boolen value determinining if pdf files or jpeg images will be  produced by the QA process  
boolen价值determinining如果PDF文件或JPEG图像将由QA流程


参数：name
The name of the process used for the headings in the HTML output.
该进程的名称用于在HTML输出的标题。


参数：...
Further arguments.
进一步的论据。


Details

详情----------Details----------

QA processes of type '2DStatsPlot' detects differences in the value of  a summary statistic such as the mean, median etc across multiple  samples.
QA流程型2 DStatsPlot“检测汇总统计的平均数，中位数等多个样品等的价值差异。

For more details on how to layout qaProcess objects to  HTML, see writeQAReport and qaReport.
对于如何布局qaProcess对象为HTML的更多细节，请参阅writeQAReport和qaReport。


值----------Value----------

An object of class qaProcess.
对象类qaProcess。


作者（S）----------Author(s)----------


Nishant Gopalakrishnan



参见----------See Also----------

writeQAReport, qaReport, qaProcess, qaProcess.marginevents, qaProcess.DensityPlot, qaProcess.ECDFPlot
writeQAReport，qaReport，qaProcess，qaProcess.marginevents，qaProcess.DensityPlot，qaProcess.ECDFPlot


举例----------Examples----------


data(qData)
dest <- tempdir()
par<-c("FSC-A","SSC-A","CD4","CD8")
resMean <- qaProcess.2DStatsPlot(qData,dyes=par,
                outdir=dest, func=mean, thresh=0.28,pdf=TRUE)
resMean




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