summarizeFile(flowPhyto)
summarizeFile()所属R语言包:flowPhyto
Compute aggregate statistics on a collection of opp or fcs files.
计算汇总统计,OPP或FCS文件的集合。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
perform aggregate statistics on a particular combination of filtered opp or fcs files for a particular population.
执行上的某一特定人群的文件过滤OPP或FCS的特定组合的汇总统计。
用法----------Usage----------
summarizeFile(opp.paths, pop.names, output.path=getCruisePath(opp.paths[1]))
参数----------Arguments----------
参数:opp.paths
Path to the raw event file to be filtered.
原始事件被过滤的文件的路径。
参数:pop.names
Abreviated name of the population subset to be summarized.
要汇总的人口子集的缩写名称。
参数:output.path
Path to the directory where you wish to output data.
你要输出数据的目录的路径。
值----------Value----------
a single row dataframe (with header) file of per population aggregate statistics on both channels and log meta information
单行dataframe(头)每人口汇总统计的两个通道上的文件和log的元信息
举例----------Examples----------
example.cruise.name <- 'seaflow_cruise'
temp.out.dir <- '.'
seaflow.path <- system.file("extdata", example.cruise.name, package="flowPhyto")
file.copy(from=seaflow.path, to=temp.out.dir, recursive=TRUE)
opp.paths <- sapply(c(1,2,3), function(i)
system.file("extdata","seaflow_cruise","2011_001", paste(i,'.evt.opp',sep=''),
package="flowPhyto"))
summarizeFile(opp.paths, pop.names='nano', output.path='.')
## optionally create a resample list [#选择创建一个重采样名单]
## to concatenate files conditionally on population concentrations[#串连文件,有条件上人口密度]
#resamp.list <- createResampleList(cruise.path, [resamp.list < - createResampleList人(cruise.path]
# resample.min=500, resamp.concat.max=5)[resample.min,resamp.concat.max = 5 = 500)]
unlink(example.cruise.name, recursive=TRUE)
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